Al elegir qué datos de servidor usar en tu programa de correo, puedes escoger entre mail.tudominio.com o imap.tudominio.com / smtp.tudominio.com.
No hay ninguna diferencia entre usar una u otra opción.
Si usas mail.tudominio.com, es probable que aparezca el error "mail certificate name mismatch" o "cannot verify server identity". Para evitarlo, consulta la guía sobre el error de certificado del correo.